Các chi tiết đầu tiên về Persona 3 đã được công bố trong tạp chí Famitsu vào tháng 3 năm 2006. Ngoài việc công bố ngày phát hành tại Nhật Bản thì bài viết dài ba trang này còn viết về các chi tiết cơ bản của trò chơi như hệ thống chiến đấu và hệ thống xã hội cũng như giới thiệu về Persona của nhân vật nam chính, Junpei và Yukari là Orpheus, Hermes và Io cùng các tính năng của các Persona này.

Khi được bản địa hóa tại các nước sử dụng tiếng Anh thì các từ đệm trong phiên bản tiến Nhật mà các nhân vật sử dụng để gọi nhau vẫn được giữ lại như -kun, -san... Trong một cuộc phỏng vấn của RPGamer với biên tập viên của dự án là Namba Yu, thì ông nói rằng trong quá trình dịch có một số các câu đùa cợt theo cách chơi chữ Nhật Bản vốn "Chẳng có nghĩa gì theo văn hóa phương Tây... nên đã thay thế bằng các câu đùa cợt khác cũng có ý nghĩa tương đương theo một cách nào đó so với kịch bản gốc". Trong một cuộc phỏng của tạp chí Play với đạo diễn của Persona 3 là Hashino Katsura nói về lý do có thêm tính năng để cho các thành viên khác trong nhóm tự quyết định hành động của hình khi chiến đấu dựa vào trí tuệ nhân tạo mà không cần trực tiếp chỉ huy. Ông nói "Tôi nghĩ rằng sẽ thú vị hơn khi để các thành viên trong nhóm tự quyết định hành động bởi trí tuệ nhân tạo của riêng họ, qua đó từng tính cách của các thành viên được thể hiện một cách sống động hơn. Cũng như không có ý kiến phản đối gì từ nhóm phát triển Persona 3 về vấn đề này" ông cũng nói rằng hệ thống này "không được đón nhận" nhiều bởi người chơi khi rất ít người sử dụng chức năng này. Persona 3 không có chức năng đàm phán như các bản Persona hay Megami Tensei trước đó, chức năng này giúp người chơi nói chuyện với đối thủ để thu phục, kiếm tiền hay lấy các đồ vật mà không phải đánh nhau nếu nhân vật chính quá mạnh hay biết cách nói chuyện. Tuy nhiên, các yếu tố xã hội của Persona 3 được xem là tương đương với hệ thống đàm phán.